二手经济适用房缴费已购经济适用房业主出售房屋有两种情况，一种情况是业主出售已经住满5年的房屋，这种情况下，业主可以依据房屋所处区域的市场价格进行出售，但出售后业主需按房屋成交总额的10％补交综合地价款。

另一种情况是业主出售尚未住满5年的经济适用房，业主只能以不高于购买时的单价出售，且必须出售给符合经济适用房购买条件的客户，而对出售方来说，可持区县国土房管局出具《按不高于经济适用住房购买单价出售经济适用房证明》到北京市建委开发办办理经济适用住房资格审核手续，还可再次购买其它地方的经济适用房。消费者购买二手经济适用房缴费情况对应地也有两种:

一种情况是具有购买经济适用房条件的人购买5年之内业主按原始价格出售的经济适用房，如果政府对购房人审批的总价大于实际购买房屋的成交总价，则购买该经济适用房需交纳税费有:契税(按成交价的1.5％缴纳)和印花税(按成交价的0.05％缴纳)，购买后的房屋产权性质仍是经济适用房。

举例来说，业主出售经济适用房原始价格28万，而政府审核该购房人购房总价标准达到30万，高于实际购房总价。则购买该套经济适用房需交纳的税费为:契税:28万×1.5％=4200元；印花税:28万×0.05％=140元。

另外，同样是购买5年之内的经济适用房，如果政府对购房人审批的购房总价低于实际购买房屋的成交总价，则购买该经济适用房需交纳税费有:契税(按成交价的1.5％缴纳)和印花税(按成交价的0.05％缴纳)，和差价部分的综合地价款10％。购买后的房屋产权性质仍是经济适用房。

举例来说，业主出售经济适用房原始价格30万，而政府审核该购房人购房总价标准达到28万，低于实际购房总价。则购买该套经济适用房需交纳的税费为:契税30万×1.5％=4500元，印花税30万×0.05％=150元，综合地价款(30万－28万)×10％=2000元。

另一种情况是对于5年以外的经济适用房，任何消费者都可以购买，而且业主可以按照市场价格出售，消费者购买该类房屋需交纳的税费有:契税(按成交价的1.5％缴纳)、印花税(按成交价的0.05％缴纳)，购买后的房屋产权性质是商品房。例:业主出售一套5年以上的经济适用房，原始价30万元，现在按目前房屋所在区域的市场价格50万元出售，则消费者购买此套房屋需交纳的税费为契税50万×1.5％=7500元；印花税50万×0.05％=250元。

证件及过户时间经济适用房再上市交易的权证过户和完税取证都是到各区房地局进行，只是未满5年的经济适用房上市交易，购买者需先到北京市房屋交易中心申请《经济适用房购买审批单》，以证明其购买经济适用房的资格，然后才能进行一般的二手房买卖程序。