首先要看你的房子的性质。

如果你的房屋呢，属于商业用房。那么您作为出租人，和承租人呢，在合同中一定会对房子的使用以及注册公司具体情况作出约定。这种是没有风险的。因为能注册公司，所以租金中也体现了它的价值。

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其次，如果你的房屋虽然是商业用房，但是针对特定的商业如餐饮，需要消防的验收，但是你的房屋不具备经营餐饮的条件，承租人一旦注册，却因为消防的原因无法营业，那对双方都是一个损失，会发生很大的争议。

如果你的房屋是住宅，那么居民住宅是不可以注册公司的。

总之来说，在房屋上注册公司，应当提前进行约定，合同期结束以后，多少天内，公司必须牵走，若未按照约定迁走，应当承担的违约责任要明确，可行，维护自己的合法权益。

以上解答，希望对您有所帮助。